Peptydy neoantygenowe|Spersonalizowana synteza peptydów neoantygenowych|Dostosowywanie długich/nierozpuszczalnych peptydów|Nauka-Peptyd
Metaopis
Potrzebujesz wysokiej jakości peptydów neoantygenowych do spersonalizowanej szczepionki przeciwnowotworowej lub badań przesiewowych komórek T-? Science-Peptide świadczy usługi syntezy peptydów neoantygenowych, obsługujące długie peptydy, sekwencje oporne na leczenie, modyfikacje w wielu-miejscach, wysoką czystość i szybką dostawę, aby pomóc w badaniach nad immunoterapią nowotworów. Zapraszamy do kontaktu z nami.
Peptydy neoantygenowe|Kluczowe składniki spersonalizowanej immunoterapii
Jak wie każdy zajmujący się immunoterapią nowotworów, znalezienie dobrego celu nie jest łatwe, a synteza przewidywanych peptydów neoantygenowych o wysokiej jakości również stanowi wyzwanie. Peptydy te są często długie, nierozpuszczalne i zawierają hydrofobowe aminokwasy, których nie można zsyntetyzować normalnymi metodami syntezy. Działamy w branży peptydów od 20 lat i otrzymaliśmy wiele zamówień na peptydy neoantygenowe i napotkaliśmy różnego rodzaju trudności - niektóre muszą zostać dostarczone na czas przed oknem terapeutycznym pacjenta, niektórych peptydów nie można dobrze wymieszać w wodzie, a w niektórych znajduje się kilka miejsc mutacji stłoczonych razem. To właśnie te doświadczenia doprowadziły nas do zbudowania systemu syntezy specjalnie dla peptydów neoantygenowych, a każdy krok, od projektowania trasy po strategię oczyszczania, miał na celu rozwiązanie problemów.

Co to są peptydy neoantygenowe?
Peptydy neoantygenowe to po prostu unikalne fragmenty białek powstałe w wyniku mutacji w komórkach nowotworowych. Mutacje te obejmują mutacje punktowe, delecje insercyjne i fuzje genów, w wyniku których powstają sekwencje aminokwasów inne niż w normalnych komórkach. Kiedy te peptydy są prezentowane na powierzchni komórki przez cząsteczki MHC, układ odpornościowy rozpoznaje, że „to jest złe” i atakuje.
W praktyce peptydy neoantygenowe dzielą się na dwie główne kategorie:
Długie peptydy (25-35 aa):kapsułkują miejsce mutacji i otaczające je sekwencje, muszą zostać połknięte przez komórki dendrytyczne, przetworzone, a następnie zaprezentowane, powszechnie stosowane w spersonalizowanych szczepionkach.
Krótkie peptydy (8-11 aa):przewidywane lub potwierdzone epitopy wiążące MHC, które można zastosować do bezpośredniej stymulacji komórek T lub do tetrameryzacji.
Niezależnie od tego, czy jest to peptyd długi, czy krótki, syntezatory Neoantigen Peptide przyprawiają o ten sam ból głowy: sekwencja jest hydrofobowa, łatwo „uderzyć” syntezatorem, wydajność oczyszczania jest niska i trzeba ją dostarczyć na czas, aby umożliwić leczenie pacjenta.
Jak Science-Peptide radzi sobie z tymi dylematami
1. Specjalizujemy się w długich i nierozpuszczalnych peptydach
Duża część docierających do nas peptydów neoantygenowych ma ponad 25 aminokwasów. Konwencjonalne metody są często nieskuteczne w walce z tymi peptydami. Przez lata wypracowaliśmy kilka sposobów radzenia sobie z nimi:
- Fragmentacja: Długi peptyd jest cięty na kilka segmentów i syntetyzowany osobno, każdy segment jest najpierw oczyszczany, a następnie składany na żywicy lub w fazie ciekłej. W ten sposób gwarantowana jest jakość każdego segmentu, a wydajność i czystość produktu końcowego są wyższe.
- Synteza-wspomagana mikrofalami: niektóre aminokwasy niechętnie reagują z ogrzewaniem mikrofalowym, wydajność reakcji zostanie natychmiast zwiększona, a produktów ubocznych jest mniej.-
- Specjalne oczyszczanie rozpuszczalnikiem: niektóre peptydy nie są rozpuszczalne w zwykłych rozpuszczalnikach, dlatego podczas oczyszczania dodajemy DMSO, chlorowodorek guanidyny i inne mocne rozpuszczalniki, aby zmyć je z kolumny, a po liofilizacji nadal mogą zachować dobre właściwości.
2. Nie brakuje ani jednego miejsca mutacji
Istota Neoantygenów Peptydów leży w tych kilku miejscach mutacji, których nigdy nie można pomylić podczas syntezy. Używamy syntezy na fazie stałej Fmoc w celu bezpośredniego wprowadzenia nie-naturalnych aminokwasów i obserwujemy dane po każdym etapie sprzęgania, aby upewnić się, że sekwencje aminokwasów w miejscach mutacji są dokładnie takie same jak w projekcie.
3. Prędkość jest trudna
Okno terapeutyczne dla pacjentów z nowotworem jest tak szerokie, że peptydy nie mają żadnego znaczenia, jeśli zostaną wprowadzone późno. Daliśmy zielone światło Neoantigen Peptides:
- Krótkie peptydy (<20 aa): 10 working days
- Długie peptydy (20-35 aa): 12-18 dni roboczych
- Przyspieszone: 7 dni roboczych do negocjacji, jeśli naprawdę się spieszysz
W zeszłym roku był klient, który już zorganizował swoich pacjentów i czekał, aż z peptydów powstanie szczepionka. Kilku naszych syntezatorów pracowało na zmiany, aby dostarczyć mu wszystkie 30 peptydów w ciągu dwóch tygodni.
4. Ścisłe kryteria czystości i endotoksyn
Kiedy używasz czegoś na ludziach, nie możesz sobie pozwolić na kompromis w kwestii jakości. Oferujemy Peptydy Neoantygenowe:
- Purity:>90%, >95%, >98% Cokolwiek wybierzesz
- Endotoksyna:<2 EU/mg, or customized according to customer requirements
- Limit mikrobiologiczny: zgodnie z Farmakopeą
- Pozostałości rozpuszczalników: zgodnie z ICH Q3C
Do raportu COA każdego peptydu dołączone są wykresy HPLC i MS, a dane można prześledzić, dlatego wielu klientów bezpośrednio je bierze i umieszcza w deklaracji.
5. Można również wykonać pielęgnację
Niektóre eksperymenty wymagają „uchwytu” dla peptydów neoantygenowych:
- Znakowanie biotyną: dla tetrameru MHC
- Znakowanie fluorescencyjne (FITC, TAMRA, Cy5): do barwienia-przepływowego
- Sprzęganie białek nośnikowych (KLH, BSA): do immunizacji zwierząt
- Modyfikacja kwasu palmitynowego: zwiększenie skuteczności szczepionek w znajdowaniu węzłów chłonnych
Możemy to wszystko zrobić wspólnie, bez konieczności szukania dwóch dostawców.
Parametry techniczne i możliwości dostosowywania
|
Parametry |
Opis |
|
długość polipeptydu |
8-50 amino acids (>35 aminokwasów zalecanych do oceny) |
|
Typ mutacji |
mutacje punktowe, delecje insercyjne, miejsca fuzji |
|
skala syntetyczna |
Miligramy, gramy (dla badań przedklinicznych) |
|
poziom czystości |
>90%, >95%, >98% do wyboru |
|
Endotoksyny |
<2 EU/mg or customized |
|
Opcjonalne modyfikatory |
Biotyna, FITC, TAMRA, Cy5/Cy7, sprzęganie KLH/BSA, kwas palmitynowy |
|
programu kontroli jakości |
Czystość HPLC, potwierdzenie masy cząsteczkowej MS, walidacja miejsca MS/MS (opcjonalnie), wykrywanie endotoksyn |
|
forma dostawy |
Liofilizowany proszek (tuba lub butelka) |



Gdzie można zastosować peptydy neoantygenowe
Spersonalizowane szczepionki neoantygenowe
Mieszamy razem kilka przewidywanych peptydów neoantygenowych, dodajemy trochę adiuwantu i wstrzykujemy je w skórę pacjenta, aby aktywować jego własne komórki T-. Dla kilku firm biotechnologicznych wyprodukowaliśmy peptydy podobne do GMP-do zastosowań klinicznych I fazy.
Badanie przesiewowe i ekspansja komórek T-
Stosując peptydy neoantygenowe do stymulacji PBMC u pacjentów, limfocyty T rozpoznające nowy antygen można zbadać, namnożyć, a następnie ponownie podać pacjentom. Wytwarzane przez nas biotynylowane peptydy można wykorzystać do przygotowania tetramerów MHC, które można sortować za pomocą cytometrii przepływowej.
Monitorowanie szczepień
Możemy dostarczyć peptydy o wysokiej czystości do pobrania krwi przed-i po-leczeniu, a także zmierzyć liczbę limfocytów T-swoistych dla neoantygenu-za pomocą peptydów neoantygenowych, aby dowiedzieć się, czy szczepionka działa, czy nie, a także wykonać testy ELISpot i ICS.
Rozwój TCR-T
Chcesz znaleźć sekwencję TCR rozpoznającą neoantygen? Należy przeprowadzić badanie przesiewowe za pomocą peptydów neoantygenowych. Zrealizowaliśmy wiele takich projektów i mamy wystarczającą liczbę peptydów i możemy dostarczyć biotynylowane do testów powinowactwa.
Dlaczego nauka-peptydów neoantygenowych?
1. 20 lat doświadczenia i wiele trudnych problemów
Działamy w tej dziedzinie od 20 lat i napotkaliśmy wszelkiego rodzaju trudne peptydy, a także mamy sposób, aby poradzić sobie z długimi łańcuchami, hydrofobowymi i powtarzalnymi sekwencjami, które są wspólne dla peptydów neoantygenowych, i nie będzie nam łatwo powiedzieć, że nie możemy tego zrobić. Niektóre peptydy, które według innych nie są możliwe do wytworzenia, często możemy znaleźć wyjście po kilku dniach badań.
2. Dotrzymuj tempa leczenia
Leczenie nowotworu nie może czekać. Szybko-prześledziliśmy program peptydów neoantygenowych, nadając priorytet całemu procesowi, od oceny po dostarczenie. Wielu klientów mówiło nam później, że wybrali nas, ponieważ dostarczyliśmy im peptyd w wymaganym czasie.
3. Jakość można zweryfikować
Niezależnie od tego, czy jest to surowy peptyd do badań naukowych, czy peptyd o wysokiej czystości i niskiej zawartości endotoksyn do badań przedklinicznych, traktujemy je wszystkie tak samo: nie mniej niż jedną część kontroli jakości i nie mniej niż jedną z danych, które należy podać. Wielu klientów bezpośrednio kopiuje nasz raport COA i umieszcza go w dokumentach deklaracji.
4. Od miligramów do gramów, bez wymiany
Wczesne wykrycie to tylko kilka miligramów, badania toksykologiczne to dziesiątki gramów, badania kliniczne to setki gramów - od początku do końca, możemy to wszystko wytrzymać. Nie musisz zmieniać tego samego gatunku i nie musisz się tym martwić.
5. Twoja sekwencja, jaką znamy tylko Ty i ja
Nowa sekwencja antygenu jest kluczowym atutem każdego klienta. Podpisujemy umowę o zachowaniu poufności, informacje o projekcie znane są tylko kilku osobom w zespole projektowym, a system danych jest bezpieczny. Przez te wszystkie lata nigdy nie było żadnego wycieku.
Prawdziwe historie kilku klientów
Firma zajmująca się terapią komórkową:mają pacjenta z zaawansowanym czerniakiem, który czeka na spersonalizowaną szczepionkę. 30 zawierającą długie peptydy, 25-35 aminokwasów, z których 8 jest wyjątkowo hydrofobowych, a wydajność oczyszczania zwykłymi metodami jest niezwykle niska. Do oczyszczenia peptydów zastosowaliśmy kondensację fragmentów i specjalne rozpuszczalniki i dostarczyliśmy je wszystkie klientowi w ciągu dwóch tygodni, a poziom endotoksyny kontrolowano na poziomie poniżej 0,05 EU/mg. Później, po leczeniu pacjenta, za pomocą testu na limfocytach T amplifikowano kilka nowych klonów-specyficznych dla antygenu, a klient specjalnie do nas zadzwonił i powiedział, że „jakość peptydu bardzo pomogła”.
Najlepszy instytut onkologiczny: they want to screen a batch of neoantigen-reactive TCRs and need 200 predicted peptides (9-11 aa). We synthesized all the peptides in three weeks using a high-throughput platform, and each peptide was >95% czystości i potwierdzone przez MS. Klient użył tych peptydów do wytworzenia tetramerów i przebadał kilka TCR-o wysokim powinowactwie, które obecnie znajdują się w fazie przedklinicznej.
Kilka pytań, które możesz zadać
P: Skąd wiesz, które mutacje tworzą dobre neoantygeny?
O: Nie zajmujemy się przewidywaniem, to zadanie bioinformatyki. Ale jeśli prześlesz nam przewidywaną sekwencję, możemy powiedzieć, czy synteza jest trudna i czy trzeba dodać trochę reszt na końcach, aby proces przebiegał płynniej.
P: Jaka jest pewność utworzenia długiego peptydu?
Odp.: W przypadku 25–35 aminokwasów ponad 85% z nich jest w porządku. Jeśli są jakieś szczególnie trudne do rozpuszczenia lub bardzo powtarzalne, być może trzeba będzie wypróbować kilka strategii (np. kondensacja fragmentów, dodanie pseudoproliny), a czas cyklu zostanie wydłużony, ale większość z nich ostatecznie da się rozwiązać.
P: Czy mogę wytwarzać peptydy do użytku klinicznego?
O: Tak. Dostarczamy peptydy neoantygenowe klasy GMP-ze ścisłą kontrolą endotoksyn, aseptycznym napełnianiem, pełnym zestawem zapisów dotyczących produkcji seryjnej i będziemy współpracować z Tobą przy składaniu wniosków IND.
P: Jak przechowywać nowy peptyd antygenowy?
Odp.: Liofilizowany proszek można przechowywać w temperaturze -20 stopni przez dwa lata. Po rozpuszczeniu lepiej umieścić go w osobnych opakowaniach w temperaturze -80 stopni, nie zamrażać i nie rozmrażać ponownie. Peptydy zawierające Cys należy chronić przed utlenianiem.
Chcesz spersonalizować swoje peptydy Neoantygenu? Zapraszam do rozmowy
Niezależnie od tego, czy dopiero rozpoczynasz badania przedkliniczne, czy już jesteś w trakcie badania klinicznego i potrzebujesz spersonalizowanego peptydu do szczepionki, Science-Peptide sobie z tym poradzi. Nasz zespół techniczny jest gotowy wysłuchać Twoich potrzeb.