Synteza długich peptydów|Dostosowywanie peptydów o długim łańcuchu|Trudna synteza peptydów|Peptydy powyżej 50mer|Nauka-Peptyd
Metaopis
Potrzebujesz długiego peptydu zawierającego ponad 50 aminokwasów? Science-Usługa syntezy długich peptydów firmy Peptide obejmuje 50–189 aminokwasów, ze strategią syntezy segmentowej, przezwyciężeniem problemów agregacji hydrofobowej i niską wydajnością syntezy, itp.. 20 lat doświadczenia i stabilnego dostarczania. Zapraszamy do kontaktu z nami.
Długie peptydy: Im są dłuższe, tym więcej problemów powodują
Dlaczego długie peptydy są trudne do wytworzenia?
Każdy, kto zajmował się syntezą peptydów, wie, że problem pojawia się, gdy łańcuch peptydowy jest długi: w granicach 20 aminokwasów większość firm jest w stanie to zrobić. Jeśli chodzi o więcej niż 40 aminokwasów, zaczynamy dobierać sekwencję. Przy 60 aminokwasach i więcej liczba firm, które mogą przejąć, zmniejsza się o połowę. Jeśli chodzi o ponad 100 aminokwasów, niewiele jest firm, które odważą się to zrobić.
Dlaczego? Ponieważ synteza długich peptydów napotyka kilka pułapek:
Wydajność syntezy maleje: przy każdym przedłużeniu aminokwasu wydajność będzie zmniejszana o jeden. 30 peptyd aminokwasowy, każdy etap z wydajnością 99%, ostateczna wydajność nadal wynosi 74%; 60 aminokwasów, każdy etap to nadal 99%, ostateczna wydajność to tylko 55%. W rzeczywistości wydajność wielu etapów nie może osiągnąć 99%.
Agregacja hydrofobowa: Kiedy w długim peptydzie znajduje się dużo aminokwasów hydrofobowych, łańcuch peptydowy zaczyna „zlepiać się” na żywicy, a aminokwasy znajdujące się za nim nie mogą przedostać się do środka.
Trudność w oczyszczaniu: czas retencji długich peptydów i zanieczyszczeń jest zbyt blisko siebie, aby można było uzyskać czyste cięcie.
Słaba rozpuszczalność: Po otrzymaniu peptydu nie można go rozpuścić, więc nie można przeprowadzić eksperymentu.
Byliśmy już w takich dziurach i wiemy, jak je ominąć.

Co możemy zrobić
1. Długość: 50-189 aminokwasów
|
zakres długości |
Trudność |
Robiliśmy sytuacje, w których |
|
50-80 aa |
Wyższa klasa średnia |
Routine program with >90% skuteczności |
|
80-120 aa |
Wysoki |
Potrzebujesz strategii syntezy segmentowej i wystarczającego doświadczenia |
|
120-150 aa |
Bardzo wysoki |
Zrobiłem ich mnóstwo, aż do 150. |
|
150-189 aa |
Niezwykle wysoki |
Poziom wyzwań z historiami sukcesu |
2. Strategia syntezy segmentowej
Najskuteczniejszym sposobem radzenia sobie z długimi peptydami jest ich segmentacja:
Wybór segmentu: Pociąć długi peptyd na 2-4 segmenty po 30-60 aminokwasów każdy. Punkt odcięcia powinien znajdować się w miejscu, w którym trudność syntezy jest niewielka, na przykład unikając ciągłego obszaru hydrofobowego.
Synteza fragmentów: każdy fragment jest syntetyzowany i oczyszczany indywidualnie do wystarczająco wysokiej czystości.
Łączenie fragmentów: łączenie fragmentów w roztworze lub na żywicy. Metoda łączenia może być naturalna, chemiczna lub enzymatyczna.
Składanie: Jeśli peptyd ma wiązanie dwusiarczkowe, po splocie należy go złożyć do prawidłowej konformacji.
3. Czystość: w zależności od wymagań eksperymentalnych
|
Poziom czystości |
Obowiązujące scenariusze |
|
Konwencjonalna czysta (85-95%) |
Połączenie eksperymentalnego, aktywnego pierwotnego badania przesiewowego |
|
Wysoka czystość (95-98%) |
eksperymenty komórkowe, walidacja funkcjonalna |
|
Ultrapure (>98%) |
Badania strukturalne, krystalografia |
Każdemu długiemu peptydowi towarzyszy raport HPLC i MS, dzięki czemu dane dotyczące czystości są przejrzyste.
4. Modyfikacje: długie peptydy mogą również dodawać funkcje
Etykietowanie fluorescencyjne: FITC, TAMRA, chcą zobaczyć, dokąd biegnie długi peptyd.
Biotyna: pociągnij-lub przetestuj.
Znakowanie izotopów: do oznaczania ilościowego NMR lub spektrometrii mas.
Fosforylacja/glikozylacja: naśladowanie modyfikacji po-translacyjnych.
Dlaczego warto przyjść do nas na Syntezę Długich Peptydów?
1. Robimy to od 20 lat
Synteza długich peptydów nie jest czymś, co każdy może zrobić. Przez lata zajmowaliśmy się wieloma długimi peptydami: transbłonowymi fragmentami białek, wirusowymi peptydami fuzyjnymi, białkami amyloidowymi, peptydami przeciwdrobnoustrojowymi itp. Mamy dobre pojęcie, które sekwencje łatwo się agregują i w jakich warunkach można je uratować. Jeśli przychodzisz do nas na Syntezę Długich Peptydów to przynajmniej nie musisz od początku stawać na dołku.
2. Synteza frakcyjna: nie tylko cięcie na kawałki
Segmentacja wydaje się prosta, ale ważne jest, gdzie wyciąć, jak długi jest każdy segment i jak je połączyć. Mamy kilka zasad:
Przetnij strefę hydrofilową: Unikaj przecinania rdzenia hydrofobowego, w przeciwnym razie segmenty same się zbiegną.
Zrównoważ długość fragmentów: nie czyń jednego segmentu szczególnie trudnym do wykonania, a innych szczególnie łatwym. 3.
Wybór punktu połączenia: Naturalne połączenia chemiczne wymagają tioestru na końcu C- i Cys na końcu N-, co należy wcześniej zaplanować.
3. Peptydy hydrofobowe: specjalny układ rozpuszczalników.
Niektóre długie peptydy są tak hydrofobowe, że nie można ich rozpuścić za pomocą konwencjonalnych rozpuszczalników, dlatego podczas syntezy będą zlepiać się na żywicy. Posiadamy specjalny system rozpuszczalników i dodatków, które utrzymują rozciąganie łańcucha peptydowego podczas procesu syntezy, dzięki czemu mogą przedostać się następujące aminokwasy.
4. Kontrola jakości: dane na każdym kroku
Kontrola jakości długich peptydów jest bardziej złożona niż w przypadku krótkich peptydów:
Kontrola jakości półproduktów: po zsyntetyzowaniu każdego fragmentu należy najpierw zmierzyć czystość i masę cząsteczkową, a następnie po przejściu testu przejść do kolejnego etapu.
Monitorowanie procesu łączenia: Wypróbuj reakcję połączenia i zmierz MS, aby zobaczyć wydajność połączenia.
Kontrola produktu końcowego: HPLC pod kątem czystości, MS pod kątem masy cząsteczkowej, MS/MS pod kątem poprawności sekwencji (opcjonalnie).
Test rozpuszczalności: Podaj zalecane rozpuszczalniki i metody solubilizacji, aby nie otrzymać peptydów, które się nie rozpuszczają.
Dane mówią same za siebie, a każdy krok można prześledzić w przypadku syntezy długich peptydów.
5. Od miligramów do stu miligramów, aż do końca
Miligramy na fazę przesiewową, dziesięć miligramów na fazę walidacji, sto miligramów na badanie strukturalne -, możemy wziąć to wszystko. Ten sam projekt, ten sam odpowiednik, nie ma potrzeby ponownej-harmonizacji.
Do czego można stosować długie peptydy?
|
Obszary badawcze |
Typowe zastosowania |
Robiliśmy sytuacje, w których |
|
białka błonowe |
fragmenty transbłonowe, pętle zewnątrzkomórkowe |
Długi peptyd z wieloma regionami transbłonowymi, wysoce hydrofobowy |
|
białka wirusowe |
Peptydy fuzyjne, domeny wiążące-receptor |
Nowy fragment białka S wirusa koronowego, około 100 aminokwasów |
|
Skrobiowaty |
A, -synukleina |
42aa to norma. Dłuższe zostały zrobione |
|
Peptydy przeciwdrobnoustrojowe |
Długołańcuchowe-peptydy przeciwdrobnoustrojowe |
Niektóre naturalne peptydy przeciwdrobnoustrojowe mają zaledwie 40-60 aminokwasów |
|
Cytokiny |
symulowanie strefy aktywnej |
50-80aa, z wiązaniami dwusiarczkowymi |
|
biologia strukturalna |
NMR, krystalografia |
Isotopically labeled peptide, purity >98%. |
Dostawa i kontrola jakości
- Dostawa: Liofilizowany proszek, probówki wirówkowe lub fiolki, zabezpieczone azotem.
- Dokumenty towarzyszące: COA (profil HPLC + profil MS), MS/MS (opcjonalnie potwierdzenie sekwencji), raport syntezy (proces segmentacji i splicingu).
- Badania opcjonalne: zawartość peptydów, endotoksyny, wilgotność, skład aminokwasowy, test rozpuszczalności.
- Indywidualne opakowanie: porcjowanie i znakowanie zgodnie z Twoimi wymaganiami.
- Przed wysłaniem każdy produkt syntezy długich peptydów jest dwukrotnie-sprawdzany w celu zapewnienia, że sekwencja jest prawidłowa, a czystość odpowiada standardom.



Trzy przypadki-z życia wzięte
Przypadek 1: Program dotyczący białek błonowych w instytucie badawczym
The customer needs a 85aa transmembrane peptide for structural study. This peptide has 60% of hydrophobic amino acids, so many companies could not make it. We used segmental synthesis, cut into three segments, each segment is about 30aa, purified and then liquid-phase ligated. The final purity of the peptide is >95%, a klient to dostał i zrobił NMR.
Przypadek 2: Program białek wirusowych międzynarodowej firmy farmaceutycznej
A 110aa viral fusion peptide with two pairs of disulfide bonds was required for inhibitor screening. We designed a segmented synthesis strategy to synthesize three linear fragments first, which were joined and then oxidized to form disulfide bonds. The final product was delivered with >Czystość 90%, prawidłowo sparowane wiązania dwusiarczkowe i pomyślnie przeszły weryfikację aktywności.
Przypadek 3: Badania nad amyloidem na uniwersytecie krajowym
The customer needs a 70aa fragment of alpha-synuclein for the study of aggregation mechanism. This peptide is easy to form fibers and always blocked the column during purification. We optimized the mobile phase conditions, added a small amount of organic solvent, and finally obtained a product with purity >95%, a klient pomyślnie przeprowadził eksperymenty ThT.
Mówisz o swoich długich potrzebach peptydowych?
Niezależnie od tego, czy potrzebujesz peptydu transbłonowego o wielkości 80 aminokwasów, czy białka wirusowego o wielkości 150 aminokwasów, możesz z nami porozmawiać. Jeśli poprosisz Science-Peptide o wykonanie długiej syntezy peptydów, przynajmniej nie będziesz musiał próbować pojedynczo.
Musisz mi powiedzieć:
Sekwencja peptydowa (lub informacja o celu)
Ile (miligramy)
wymagania czystości
nie mają wiązań dwusiarczkowych ani innych modyfikacji
Kiedy tego chcesz?
W ciągu 24 godzin otrzymasz ocenę wykonalności i wycenę.